检疫旅馆原本被台湾流行疫情指挥中心视为"防护罩"，如今却可能成为防疫破口。据台湾媒体报道，去年十二月八日确诊的浙江台商，经病毒基因定序，其病毒竟与同住台北市某家检疫旅馆、自德国入境的确诊者几乎一样。台湾感染科专家认为，这证实浙江台商应该是在防疫旅馆染疫。

台流行疫情指挥中心去年12月8日公布一名境外输入个案，为一名持阴性证明返台的50多岁浙江台商。由于他是返台后第12天才出现症状，经检测发现体内病毒量高，遭专家研判是刚发病。台大儿童医院院长黄立民当时就认为，台商有可能为"本土感染"，或者"旅馆存在防疫破口"。6日，台流行疫情指挥中心证实，在比对该名台商与同旅馆另一名德国入境确诊者体内病毒后，发现两人的病毒基因定序几乎一样，推测为同一株病毒株。

台大医院儿童感染科主任 黄立民：如果他们两个的基因序列很相似，甚至是相同的话，代表他们是同一个传染链，或者是同一个群聚事件的两个个案，那你就要回顾这两个人，发病前14天去过哪些地方。

台流行疫情指挥中心发言人庄人祥表示，检疫者到这家防疫旅馆报到后，都走楼梯到各自的房间，检疫期间使用通讯软件跟旅馆人员沟通，外送餐点也放在门口，检疫者不用走出房间，两人也不是同一天抵达旅馆，没有接触的可能。而专家认为，浙江台商在旅馆染疫，不排除是空气传播。

台大医院儿童感染科主任 黄立民：旅馆可能的传染途径，就包含通风或者是动线，比如说两人是不是都是，完全没有离开房间，或是有什么工作人员，因为特别原因，进入过两人房间，然后这些人是不是别人有感染，进入这个旅馆。

尽管台流行疫情指挥中心负责人陈时中表示，由于经过扩大采检周边工作人员与住户后，各类检验结果均为阴性，不过专家还是认为不具代表性，浙江台商的感染源到底为何，已经难以推论，未来要如何降低间接感染的机率，依旧是个考验。