目前台湾疫苗短缺，即将陷入"空窗期"，有国民党民代指出，8月14日后，全台恐无疫苗可打。可即便如此，民进党当局5日下午重启疫苗登记之后，愿意施打台产高端疫苗的民众反而明显减少，这也显示出多数民众对台产疫苗的接受度不高。

台湾疫苗覆盖率低，却不时传出疫苗短缺状况，国民党民代提出警讯，如果再没有外购疫苗补充，很快台湾就没有疫苗可施打。

国民党民代 万美玲：8月14日之前，我们还没有新的疫苗进来，大概还有9天，我们就没有疫苗可以打了。

台北市长 柯文哲：你让国际上，已经可以认证的疫苗，故意拖延不让它进入台湾，阿斯利康疫苗你知道，跟日本买都可以，BNT疫苗民进党当局真的要买，要拖这么久吗？

外界质疑，民进党当局借着疫苗短缺，在护航高端疫苗，但目前岛内民众对台产高端疫苗的接受度却并不高。5日下午，岛内新冠疫苗施打意愿登记与预约系统平台重启登记，仅3小时，勾选高端疫苗的民众便从3日的99万多减少到98万，减少了1.6万人。从疫苗登记的意愿统计来看，勾选阿斯利康疫苗有87万多人，单选莫德纳疫苗的有385万多人，而钟情于高端疫苗的民众仅17万多人，接受度极低。

就在疫苗紧缺的当下，台湾流行疫情指挥中心却宣布，开放第一线医护人员在接种阿斯利康后，第二剂疫苗可以混打同属mRNA疫苗的莫德纳或是BNT疫苗。有台湾医师担忧，疫苗不足，此时开放混打疫苗，反而会造成部分民众无法接种第一剂疫苗，导致群体保护力下降，台湾应考虑等下一批疫苗进货了，再开放混打，对整体防疫才有帮助。