由于染疫的台海军"敦睦舰队"曾靠岸高雄左营军港，高雄市的防疫工作更加严峻，高雄市长韩国瑜拟对高雄4000多名医护人员进行普筛，却引发争议。台湾流行疫情指挥中心指挥官陈时中声称"不见得有普筛的必要"，绿营议员更是一面倒炮轰韩国瑜。

高雄医护人员：去被筛我觉得无妨，只是我觉得要有配套措施。

高雄市长韩国瑜拟对高雄4000多名医护人员进行普筛，并称已筹措经费。而台湾流行疫情指挥中心指挥官陈时中认为，医护人员本来就被列为扩大采检对象，只要有需要就能采，不见得有普筛的必要。

台湾地区流行疫情指挥中心指挥官 陈时中：有必要就可以采也不用再筹措财源，来做这件事情。

除了陈时中不赞同韩国瑜的做法，绿营议员也一面倒炮轰韩国瑜。

高雄市议员 黄捷：为什么现在韩市长，你就又把这个拿出来当作你的"支票"，我们检疫能量真的，足够应付这么一次，大规模的筛检人数吗。

高雄市议员 黄文益：医护人员发生伪阳性，后续的配套措施怎么处理，隔离吗？然后实验室都关起来吗？

台军群聚疫情暴发后，由于高雄的涉事官兵最多，韩国瑜随即大动作展开消杀、疫调等各种工作。不过，针对韩国瑜的防疫举措，台流行疫情中心指挥官陈时中却频频出来拆台。先是阻挠韩国瑜对拒绝检疫的24名官兵开罚，现在连医护人员普筛都驳回。对此，有观察认为，这波疫情打乱了"罢韩"节奏，给了韩国瑜展现施政能力的机会，从而给将于6月6日举行的"罢韩"投票增加新的不确定性，韩国瑜可能由此"转危为安"，因此，绿营有意借疫情坑害韩国瑜。

台湾《联合报》也指出，这次碰到"敦睦舰队"疫情风暴，陈时中对疫调工作的态度突然改变。疫情暴发后，陈时中迟迟不给县市首长官兵名单，韩国瑜说他要了三天才拿到名单，结果连夜赶工疫调，却有官兵拒绝配合。而陈时中为官兵缓颊，竟声称"无法定义这些官兵是否有义务接受调查"。面对绿营的炮轰，韩国瑜能否借处理疫情扭转不利局面，仍有待观察。

韩国瑜防疫表现 将成“罢韩”转折点？

台海军舰队暴发疫情后，高雄防疫升温成为焦点，但是，因为国民党籍高雄市长韩国瑜与台流行疫情指挥中心指挥官陈时中屡屡不同调，再度引发蓝绿防疫攻防战。民进党当局带风向让韩国瑜要"顺时中"，不要"逆时中"，岛内各界对此怎么看，韩国瑜在防疫上的表现，究竟能够打几分？

台海军"敦睦舰队"群聚染疫事件撕开岛内防疫破口，也出现"罢免韩国瑜"破口，原本拼市政的韩国瑜开始拼防疫，慢慢转守为攻。与此同时，绿营也加强力道，一律反对到底。对此，香港中评网发文指出，"逢韩必反"已经变成这两天的氛围，民进党当局屡屡唱反调，自然是针对"罢韩案"而来，避免韩国瑜透过防疫得分。不过，随着疫情延烧，民进党当局的防疫举措已然失控，陈时中反对高雄办封城兵推、反对韩国瑜为全市医护普筛，伤了民进党当局的"防疫神话"，陈时中也将走下"神坛"，卷入政治漩涡。

而此次韩国瑜在疫情防控上的积极作为，也为自己的未来争取到了希望，事实上，韩国瑜积极强化防疫，已让高雄的防疫从"顺时中"变为"超时中"。台湾《联合报》指出，"敦睦舰队"染疫案延烧，高雄市长几度向民进党当局喊话，展现出守护市民的防疫态度。韩国瑜或将借此扳回一局，改变"罢韩"局面。

在被罢免的压力下，韩国瑜所带领的高雄市府团队，到底做得好不好，不是陈时中说了算，而是要看民众怎么说。通过此次疫情中的表现，很多人的态度确实发生了转变，像是台湾清华大学博士生何坤轩就说，有人喜欢看高楼大厦，以为有大工程就是做得好。但是韩国瑜这一年来从关爱未婚妈妈到发放弱势餐券，再到此次疫情当中的坚守和执着，都敲击着市民的内心，唤起了市民内心对于过往的美好回忆。